كان منصب بنعمر كمبعوث أممي  إلى اليمن من أبرز محطاته ومسيرته الدبلوماسية، وقد مارس دورا مشبوها منذ تعيينه مبعوثا أمميا لليمن في أغسطس/آب 2012 وحتى تقديم استقالته في أبريل/نيسان 2015، أي بعد اندلاع الحرب بأٌقل من شهر.